带状疱疹后遗神经痛的发病原因目前尚不清楚，根据带状疱疹的病理学研究及其发病期的临床表现，可大致将其原因概括为以下三方面。
1、周围神经异常 据研究证实周围神经功能缺失与自发痛或触觉痛之间并不是简单的关系，带状疱疹后遗神经痛病人的疼痛区内可能存在着多种感觉方式，最初的伤害感受器传入刺激使周围神经与中枢之间发生持续联系，由此促成带状疱疹后遗神经痛的持续疼痛。
2、中枢神经病变 有人用放射性同位素PET技术(阳电子放射X线体层扫描照像，positron emission tomography, PET) 对慢性疼痛病人脑活动程度进行对比研究，发现疼痛病人患肢对侧的丘脑活动降低明显，认为丘脑对疼痛调制环路的功能改变，可能是导致慢性疼痛的重要原因。而带状疱疹存在并发症无菌性脑膜炎也正说明带状疱疹在引起周围神经病变的同时，也可能累及中枢神经系统。
3、精神因素 目前该因素对本病的影响有待进一步证实，可能与本病的疼痛症状有关。
